丹參也有它的副作用，實踐證明，丹參對胃腸有刺激作用，如長期服用丹參，可引起不同程度的納呆、泛酸等癥。
丹參臨床應用時的注意事項
1、有胃腸疾病的人服用丹參時可加服陳皮、雞內金、白扁豆等健胃之。
2、患心動過緩者，可加用桂枝、薤白等通心之藥。
患心動過緩者，可加用桂枝、薤白等通心之藥
3、癌癥病人需活血治療的，不用丹參，可選用經藥理研究有抗癌作用的中藥，如全蟲、蜈蚣、蛇蛻、莪術、三棱、水蛭、穿山甲等。
4、丹參不可和阿司匹林一起服用。阿司匹林具有抑制血小板聚集的作用，目前已被作為冠心病患者治療的基本藥物。